Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms