Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rmi2Q3UPE3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms