Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skap2Q3UND0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms