Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tmem253Q3UNB8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Tmem253Q3UNB8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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