Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cog7Q3UM29 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms