Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrxosQ3UL53 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms