Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smu1Q3UKJ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms