Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UJP5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms