Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edc4Q3UJB9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms