Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms