Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zyg11bQ3UFS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zyg11bQ3UFS0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms