Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms