Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms