Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Rnf180Q3U827 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf180Q3U827 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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