Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ulk3Q3U3Q1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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