Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gse1Q3U3C9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms