Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LcorlQ3U285 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms