Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms