Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms