Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf6Q3TWW8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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