Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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