Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3TTJ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms