Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxw18Q3TSA9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fbxw18Q3TSA9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms