Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc102aQ3TMW1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms