Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem38aQ3TMP8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem38aQ3TMP8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms