Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms