Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Prr27Q3SYJ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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