Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hddc2Q3SXD3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hddc2Q3SXD3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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