Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Colec11Q3SXB8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Colec11Q3SXB8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Colec11Q3SXB8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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