Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nell1Q2VWQ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nell1Q2VWQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms