Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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Shroom4Q1W617 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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Shroom4Q1W617 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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Shroom4Q1W617 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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Shroom4Q1W617 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shroom4Q1W617 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shroom4Q1W617 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms