Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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