Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myo3bQ1EG27 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms