Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cers3Q1A3B0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms