Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpusd3Q14AI6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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