Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms