Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VgfQ0VGU4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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VgfQ0VGU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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VgfQ0VGU4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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VgfQ0VGU4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms