Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms