Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms