Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ttc39dQ0VF76 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ttc39dQ0VF76 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc39dQ0VF76 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc39dQ0VF76 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc39dQ0VF76 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms