Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms