Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 325.3 ms