Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms