Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Znf541Q0GGX2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms