Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ssrp1Q08943 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms