Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Hoxc4Q08624 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc4Q08624 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms