Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms