Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cnn1Q08091 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms