Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox4Q06831 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms