Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tie1Q06806 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tie1Q06806 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms